Een waterontharder heeft geen invloed op het fluoridegehalte in het water. Fluoride is een opgeloste stof die, in tegenstelling tot mineralen zoals calcium en magnesium, niet door een waterontharder wordt verwijderd. Waterontharders werken door middel van ionenuitwisseling, waarbij calcium- en magnesiumionen worden vervangen door natriumionen, maar fluoride blijft ongewijzigd in het water (Alles over Water).
In Nederland wordt fluoride soms bewust aan drinkwater toegevoegd vanwege de voordelen voor de tandgezondheid, zoals bescherming tegen gaatjes en het versterken van het tandglazuur. Dankzij de regulering van het fluoridegehalte door gezondheidsinstanties, zoals het RIVM, blijft het niveau binnen veilige en effectieve grenzen. Omdat fluoride niet door waterontharders wordt beïnvloed, blijven deze gezondheidsvoordelen behouden, zelfs als je onthard water drinkt (Radar).
Kortom, waterontharders veranderen het gehalte aan fluoride in je drinkwater niet. Het fluoride blijft in dezelfde hoeveelheid aanwezig, zodat je veilig kunt genieten van de voordelen voor de tandgezondheid, zelfs wanneer je een waterontharder gebruikt (Het Consumentenbelang).