In Nederland zijn er weinig verschillen tussen onthard water en regulier kraanwater als het gaat om bacteriën en andere verontreinigingen. Kraanwater wordt hier streng gecontroleerd op biologische en chemische veiligheid. Drinkwaterbedrijven filteren en zuiveren het water op grote schaal om te voldoen aan strenge normen voor verontreinigingen en bacteriën, wat betekent dat het water dat uit onze kranen komt veilig is om te drinken, zonder dat verdere filtratie nodig is (Drinkwaterplatform).
Hoewel onthard water door een extra bewerking gaat waarbij mineralen zoals calcium en magnesium worden vervangen door natrium, heeft dit geen invloed op het aantal bacteriën of verontreinigingen. De bacteriologische veiligheid blijft intact, omdat ontharding vooral de waterhardheid verandert, niet de zuiverheid van het water (Radar).
Er zijn echter enkele aandachtspunten bij het gebruik van een waterontharder. Bij onvoldoende onderhoud kan een waterontharder namelijk een broedplaats worden voor bacteriën. Dit kan gebeuren wanneer het onthardingssysteem niet regelmatig gereinigd en onderhouden wordt. Om bacteriegroei te voorkomen, raden drinkwaterbedrijven zoals Vitens aan om de ontharder goed te onderhouden en een terugstroombeveiliging te installeren. Hiermee wordt voorkomen dat verontreinigd water terugstroomt in het drinkwaternet (Vitens).
Samengevat: kraanwater in Nederland is van nature veilig en bevat weinig bacteriën of verontreinigingen. Onthard water biedt dezelfde veiligheid, zolang de ontharder goed wordt onderhouden.